Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC102BQ68D86 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC102BQ68D86 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms