Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRCH2Q5VUJ6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRCH2Q5VUJ6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms