Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HES3Q5TGS1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HES3Q5TGS1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms