Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDGFL1Q5TGJ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms