Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB6CQ53S08 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6CQ53S08 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms