Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DUSP28Q4G0W2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP28Q4G0W2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms