Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KRTAP21-3Q3LHN1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms