Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC85BQ15834 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC85BQ15834 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms