Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NKX1-1Q15270 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NKX1-1Q15270 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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