Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
R3HDM1Q15032 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
R3HDM1Q15032 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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