Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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COL19A1Q14993 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL19A1Q14993 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL19A1Q14993 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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