Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NFIXQ14938 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFIXQ14938 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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