Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GOLGA4Q13439 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms