Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FOXO1Q12778 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms