Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SREBF2Q12772 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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