Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CGNL1Q0VF96 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CGNL1Q0VF96 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms