Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR1Q08345 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms