Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SRSF4Q08170 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms