Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LRP1Q07954 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms