Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
TNP2Q05952 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TNP2Q05952 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms