Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GBE1Q04446 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GBE1Q04446 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms