Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HERVK_113P63132 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P63132 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms