Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HDGFP51858 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HDGFP51858 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HDGFP51858 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HDGFP51858 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HDGFP51858 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HDGFP51858 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
HDGFP51858 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms