Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMPOP42166 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMPOP42166 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMPOP42166 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMPOP42166 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMPOP42166 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMPOP42166 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms