Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6BP35913 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms