Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSG3P32926 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG3P32926 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSG3P32926 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSG3P32926 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DSG3P32926 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms