Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRKCHP24723 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms