Protein–RNA interactions for Protein: P24158

PRTN3, Myeloblastin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3P24158 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRTN3P24158 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms