Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRGP23470 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PTPRGP23470 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRGP23470 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
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