Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EFNA1P20827 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms