Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF3P18847 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF3P18847 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF3P18847 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF3P18847 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF3P18847 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF3P18847 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF3P18847 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms