Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VAV1P15498 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VAV1P15498 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VAV1P15498 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAV1P15498 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms