Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DEFA4P12838 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DEFA4P12838 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms