Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP17L8P0C7I0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms