Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MSMBP08118 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MSMBP08118 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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