Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCCAP05165 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCCAP05165 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCCAP05165 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCCAP05165 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCCAP05165 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCCAP05165 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms