Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EGFRP00533 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EGFRP00533 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EGFRP00533 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EGFRP00533 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms