Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX58O95786 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX58O95786 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms