Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIAA0556O60303 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KIAA0556O60303 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms