Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COCHO43405 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
COCHO43405 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
COCHO43405 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COCHO43405 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COCHO43405 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COCHO43405 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COCHO43405 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COCHO43405 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms