Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PIK3C2BO00750 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2BO00750 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms