Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLRMTO00411 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLRMTO00411 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms