Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIP1O00291 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIP1O00291 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIP1O00291 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIP1O00291 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIP1O00291 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIP1O00291 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms