Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
B4DXG7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
B4DXG7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
B4DXG7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
B4DXG7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms