Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms