Protein–RNA interactions for Protein: A8K010

LINC00473, Putative transcriptional regulator encoded by LINC00473, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00473A8K010 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00473A8K010 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms