Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF316A6NFI3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF316A6NFI3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms