Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
TMOD4Q9NZQ9 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms