Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms