Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL24A1Q17RW2 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms